Научно-исследовательский институт биологии

Об институте

русский / english 

   Научно-исследовательский институт биологии Иркутского государственного университета (ранее Биолого-географический институт, БГНИИ) создан в 1923 году постановлением Наркомпроса России. В 2013 институт отметил 90-летний юбилей.  

   С 1920-х гг. в институте работал ряд профессоров, ставших известнейшими иркутскими исследователями, в частности, Б.А. Сварчевский (первый директор БГНИИ), В.Ч. Дорогостайский, С.И. Тимофеев, В.И. Смирнов и др. Виднейшей фигурой в становлении и развитии БГНИИ / НИИ биологии был доктор биологических наук, профессор М.М. Кожов (1890-1968), пришедший в институт в 1925 г. и ставший его директором в 1931 г. Его дочь, доктор биологических наук, профессор О.М. Кожова (1931-2000) руководила институтом в 1971-1981 и 1990-2000 гг. В период с 2002 по 2008 гг. институтом руководила продолжатель научной династии к.б.н. Л.Р.Изместьева (внучка М.М.Кожова). В настоящее время институт возглавляет д.б.н. М.А. Тимофеев.

   В институте 4 лабораторий а также 2 научно-исследовательские группы, в которых работают 5 докторов и 17 кандидатов наук. НИИ биологии проводит научно-исследовательские работы фундаментального и прикладного характера, а также выступает в качестве базы для обучения студентов и аспирантов ИГУ современным методам биологических исследований.

   Главные научные направления института связаны с проведением фундаментальных и прикладных научно-исследовательских работ по изучению структуры и функционирования биоценозов озера Байкал и Байкальской природной территории, оценке их экологического состояния.  Ведущие сотрудники института выполняют исследовательские работы в области экологии и гидробиологии озера Байкал, экофизиологии и молекулярной биологии эндемичных гидробионтов, а также экспериментальной токсикологии и биотехнологии, орнитологии, микробиологии и др.

    Базой для основной части гидробиологических исследований является Байкальская биостанция в пос. Большие Коты. Она состоит из учебных, лабораторных и жилых зданий, музея байкаловедения.  Работы на Байкале ведутся с помощью научно-исследовательского судна "М.М.Кожов".  

   Институт активно участвуют в программах сотрудничества и международных коллаборациях с ведущими научными организациями Беларусии, Украины, Германии, Великобритании, США, Сингапура, Финляндии, Японии и др.  

     В марте 2013 года распоряжением Правительства Российской Федерации N 281-р  группе сотрудников НИИ биологии "ИГУ" присуждена премия Правительства Российской Федерации 2012 года в области науки и техники для молодых ученых и присвоено звание "Лауреат премии Правительства Российской Федерации в области науки и техники для молодых ученых".

 С февраля 1945 года в НИИ биологии "ИГУ" выполняется уникальное по продолжительности мониторинговое исследование байкальского планктона. Проект долговременного мониторинга озера Байкал, известный также как «Точка №1», внесен в Книгу рекордов России как самый длительный проект регулярного экологического мониторинга в истории науки.

 

Последние публикации сотрудников института

 

Drozdova P, Saranchina A, Morgunova M, Kizenko A, Lubyaga Y, Baduev B, Timofeyev M. 2020. The level of putative carotenoid-binding proteins determines the body color in two species of endemic Lake Baikal amphipods. PeerJ 8:e9387 (Q1, IF 2.35)  
     
Burskaia V., S. Naumenko, M. Schelkunov, D. Bedulina, T. Neretina, A. Kondrashov, L. Yampolsky, G.A Bazykin, Excessive parallelism in protein evolution of Lake Baikal amphipod species flock, Genome Biology and Evolution, , evaa138, https://doi.org/10.1093/gbe/evaa138  
     

Ozersky T., Nakov T., Hampton S., Rodenhouse N., Shchapov K., Woo K., Wright K., Pislegina E., Izmesteva L., Silow E., Timofeyev M., Moore M. “Hot and sick? Impacts of warming and a parasite on the dominant zooplankter of Lake Baikal”, Limnology and Oceanography, 2020, in press. (IF 4.325, Q1)

 
     
Lubyaga et al. "Invader amphipods Gmelinoides fasciatus (Stebbing, 1899) inhabiting distant waterbodies demonstrate differences in tolerance and energy metabolism under elevated temperatures" Journal of Great Lakes Research (IF 2.17, Q1)  
     
Voitsekhovskaia, I.; Paulus, C.; Dahlem, C.; Rebets, Y.; Nadmid, S.; Zapp, J.; Axenov-Gribanov, D.; Rückert, C.; Timofeyev, M.; Kalinowski, J.; Kiemer, A.K.; Luzhetskyy, A. Baikalomycins A-C, New Aquayamycin-Type Angucyclines Isolated from Lake Baikal Derived Streptomyces sp. IB201691-2A. Microorganisms 2020, 8, 680.  
     
Drozdova, P., Madyarova, E., Dimova, M., Gurkov, A., Vereshchagina, K., Adelshin,R.,  Timofeyev,  M.,  The  diversity  of  microsporidian  parasites  infecting  the  Holarctic  amphipod Gammaruslacustris  from  the  Baikal  region  is  dominated  by  the  genus Dictyocoela, Journal  of  Invertebrate  Pathology (2020),    
     
Protasov ES, Axenov-Gribanov DV, Shatilina ZM, Timofeyev MA, Lane AL (2020) Freshwater Actinobacteria from sediments of the deep and ancient Lake Baikal (Russia) and their genetic potential as producers of secondary metabolites. Aquatic Microbial Ecology 84:1-14.  
     
Protasov, E.S., Axenov-Gribanov, D.V., Rzhechitsky, Y.A. V. A. Emshanova, Y. A. Shirokova, M. A. Timofeyev. Diversity of culturable actinobacteria associated with deepwater endemic amphipods of Lake Baikal and study of their biosynthetic capabilities.  Limnology (2020).    
     

Shatilina Zh., P. Drozdova, D. Bedulina, L. Rivarola-Duarte, S. Schreiber, C. Otto, F. Jühling, S. Aulhorn, W. Busch, Y. Lubyaga, E. Kondrateva, T. Pobezhimova, L. Jakob, M. Lucassen, F. J. Sartoris, J. Hackermüller, H.O. Pörtner, P.F. Stadler, T. Luckenbach (2020) Transcriptome-level effects of the model organic pollutant phenanthrene and its solvent acetone in three amphipod species. Comparative Biochemistry and Physiology - Part D: Genomics and Proteomics. 33,100630  

 
     
P.B. Drozdova, Y.A. Barbitoff, M.V. Belousov, R.K. Skitchenko, T.M. Rogoza, J.Y. Leclercq, A.V. Kajava, A.G. Matveenko, G.A. Zhouravleva, S.A. Bondarev (2020) Estimation of amyloid aggregate sizes with semi-denaturing detergent agarose gel electrophoresis and its limitations, Prion, 14:1, 118-128,
 
     
Axenov-Gribanov, D. V., Bedulina, D. S., Shirokova, Y. A., Emshanova, V. A., Lubyaga, Y. A., Vereshchagina, K. P., Saranchina, A. E., Pobezhimova, T. P., & Timofeyev, M. A. (2019). Diet influence on mechanisms of non-specific stress-response in Baikal endemic amphipod species during long-term laboratory exposure, Crustaceana, 92(11-12), 1349-1368.   

Kochneva A. P. Drozdova, E. Borvinskaya. The first transcriptomic resource for the flatworm Triaenophorus nodulosus (Cestoda: Bothriocephalidea), a common parasite of holarctic freshwater fish. Marine genomics.– 2019.  doi.: 10.1016/j.margen.2019.100702Get

 

M.V. Moore, B.T. Jr. De Stasio, K.N. Huizenga, E.A. Silow. Trophic coupling of the microbial and the classical food web in Lake Baikal, Siberia. Freshwater Biology. – 2019. – V. 64, N 1. – P. 138-151. DOI: 10.1111/fwb.13201. 

 
Drozdova P., Rivarola-Duarte L., D. Bedulina, D. Axenov-Gribanov, S. Schreiber, A. Gurkov, Zh. Shatilina, K. Vereshchagina, Y. Lubyaga, E. Madyarova, C. Otto, F. Jühling, W. Busch, L. Jakob, M. Lucassen, F. J. Sartoris, J. Hackermüller, S. Hoffmann, H.O. Pörtner, T. Luckenbach, M.Timofeyev, P.F. Stadler (2019) Comparison between transcriptomic responses to short-term stress exposures of a common Holarctic and endemic Lake Baikal amphipods. BMC Genomics. Volume 20, Article number: 712    
     
Shchapova, E.; Nazarova, A.; Gurkov, A.; Borvinskaya, E.; Rzhechitskiy, Y.; Dmitriev, I.; Meglinski, I.; Timofeyev, M. Application of PEG-Covered Non-Biodegradable Polyelectrolyte Microcapsules in the Crustacean Circulatory System on the Example of the Amphipod Eulimnogammarus verrucosus. Polymers, 2019, 11, 1246.  
     
A.Gurkov, L.Rivarola-Duarte, D.Bedulina, I.Fernández Casas, H. Michael, P.Drozdova, A.Nazarova, E.Govorukhina, M.Timofeyev, P.F. Stadler, T. Luckenbach (2019) "Indication of ongoing amphipod speciation in Lake Baikal by genetic structures within endemic species". BMC Evolutionary Biology. 19:138
 
     
P. Drozdova, D. Bedulina, E. Madyarova, L. Rivarola-Duarte, S. Schreiber, P. F. Stadler, T. Luckenbach, M. Timofeyev (2019) "Description of strongly heat-inducible heat shock protein 70 transcripts from Baikal endemic amphipods", Scientific reports, 9,  8907   
     

M.V. Moore, B.T. De Stasio Jr., K.N. Huizenga, E.A. Silow (2018) Trophic coupling of the microbial and the classical food web in Lake Baikal, Siberia. Freshwater Biology. DOI: 10.1111/fwb.13201

 
     
Vereshchagina K.P., Kondrateva E.S., Axenov-Gribanov D.V., Shatilina Zh.M.,Khomich A.S., Bedulina D.S., Zadereev E. S., Timofeyev M.A. (2018) Nonspecific stress response to temperature increase in Gammarus lacustris Sars with respect to oxygen-limited thermal tolerance concept. PeerJ 6:e5571  
 
     

Voytsekhovskaya IV, Axenov-Gribanov DV, Murzina SA, Pekkoeva SN, Protasov ES, Gamaiunov SV, Timofeyev MA. (2018) Estimation of antimicrobial activities and fatty acid composition of actinobacteria isolated from water surface of underground lakes from Badzheyskaya and Okhotnichya caves in Siberia. PeerJ 6:e5832  

 
     
R. I. Woolway, L. Carrea, C. J. Merchant, M. T. Dokulil, E. de Eyto, C. L. DeGasperi, J. Korhonen, W. Marszelewski, L. May, A. M. Paterson, A. Rimmer, J. A. Rusak, S. G. Schladow, M. Schmid, S. V. Shimaraeva, E. A. Silow, M. A. Timofeyev, P. Verburg, S. Watanabe, and G. A. Weyhenmeyer, 2018: Lake surface temperature [in “State of the Climate in 2017”]. Bull. Amer. Meteor. Soc., 99 (8), S13–S15, doi:10.1175/2018BAMSStateoftheClimate.1.  
     
Dimova M., Madyarova E., Gurkov A., Drozdova P., Lubyaga Y., Kondrateva E., Adelshin R., Timofeyev M.  Genetic diversity of Microsporidia in the circulatory system of endemic amphipods from different locations and depths of ancient Lake Baikal. 2018.  PeerJ 6:e5329
 
     
Borvinskaya, E., Gurkov, A., Shchapova, E., Karnaukhov, D., Sadovoy, A., Meglinski, I., Timofeyev, M. Simple and Effective Administration and Visualization of Microparticles in the Circulatory System of Small Fishes Using Kidney Injection. J. Vis. Exp. (136), e57491, doi:10.3791/57491 (2018).  
     
Bowman, L. L., Kondrateva, E. S., Timofeyev, M. A. and Yampolsky, L. Y. (2018), Temperature gradient affects differentiation of gene expression and SNP allele frequencies in the dominant Lake Baikal zooplankton species. Molecular ecology.  doi:10.1111/mec.14704  
     
Gurkov, A., Borvinskaya, E., Shchapova, E., Timofeyev, M.  Restraining small decapods and amphipods for in vivo laboratory studies (2018) Crustaceana, 91 (5), pp. 517-525. 
 
     
Borvinskaya, E., Gurkov, A., Shchapova, E., Baduev, B., Meglinski, I., Timofeyev, M. Distribution of PEG-coated hollow polyelectrolyte microcapsules after introduction into the circulatory system and muscles of zebrafish (2018) Biology Open, 7 (1), статья № bio030015, .   
     
Shchapova, E.P., Axenov-Gribanov, D.V., Lubyaga, Y.A., Shatilina, Z.M., Vereshchagina, K.P., Madyarova, E.V., Protasov, E.S., Timofeyev, M.A. Crude oil at concentrations considered safe promotes rapid stress-response in Lake Baikal endemic amphipods (2018) Hydrobiologia, 805 (1), pp. 189-201.   
     
Protasov, E.S., Axenov-Gribanov, D.V., Rebets, Y.V., Voytsekhovskaya, I.V., Tokovenko, B.T., Shatilina, Z.M., Luzhetskyy, A.N., Timofeyev, M.A. The diversity and antibiotic properties of actinobacteria associated with endemic deepwater amphipods of Lake Baikal (2017) Antonie van Leeuwenhoek, International Journal of General and Molecular Microbiology, 110 (12), pp. 1593-1611.  
     
Borvinskaya E., Gurkov A., Shchapova E., Baduev B., Meglinski I., Timofeyev M.  Distribution of PEG-coated hollow polyelectrolyte microcapsules after introduction into the circulatory system and muscles of zebrafish. Biology Open 2018. 7: bio030015      
     
Hampton S.E,…, Silow E.A.,…, Timofeyev M.A., et al. Ecology under lake ice. Ecology letters, (2017) 20: 98–111  
     
Timofeyev M.A., Silow E.A., Mackay A.W., Moore M.V., Likens G.E. (2016) Safeguarding the world’s largest lake. Nature. Vol.538, № 7623, pp. 41  
 
 
 
Sharma, S… L.R. Izmest’eva, E.A. Silow… et al. A global database of lake surface temperatures collected by in situ and satellite methods from 1985–2009. Scientific Data (Nature Publishing Group) 2:150008 doi: 10.1038/sdata.2015.8.
 
 

Новости

 

Август 2020. 4 августа в диссертационном совете Института биологии внутренних вод имени И. Д. Папанина РАН состоялась успешная защита диссертаций на соискание степени кандидата биологических наук двух научных сотрудников НИИ биологии «ИГУ» - Верещагиной Ксении Петровны (диссертация на тему «Влияние длительной холодовой и тепловой акклимации на неспецифический стресс-ответ и энергетический метаболизм байкальских эндемичных и голарктических амфипод») и Гуркова Антона Николаевича (диссертация на тему «Исследование вариабельности pH внутренних сред гидробионтов в стрессовых условиях in vivo»)
---
Июль 2020. На странице научно-информационного портала N+1 опубликованы комментарии директора НИИ биологии "ИГУ" д.б.н. Максима Тимофеева относительно серии недавних сообщений в центральных СМИ о "стремительной потери прозрачности" вод озера Байкал.  см: "Мутнеет ли Байкал?"
---
Июль 2020.  Журнал Genome Biology and Evolution (Q2, IF 3.462) принял в печать новую статью с участием сотрудников  НИИ биологии "ИГУ": Burskaia et al. "Excessive parallelism in protein evolution of Lake Baikal amphipod species flock"
---
Июль 2020. Молодые ученые НИИ биологии "ИГУ" Ярослав Ржечицкий и Дмитрий Карнаухов победители конкурса грантов для поддержки НИР аспирантов и молодых сотрудников ИГУ.
---

Июнь 2020. На страницах научно-популярного портала "Индикатор" вышла статья о проводимых в НИИ биологии ИГУ исследованиях. См: "Пеструю окраску байкальским рачкам придают белки, которые у других отвечают за распознавание запахов".

---
Июнь 2020.  Журнал PeerJ (Q1, IF 2.35) опубликовал новую статью сотрудников  НИИ биологии "ИГУ": Drozdova et al.  "The level of putative carotenoid-binding proteins determines the body color in two species of endemic Lake Baikal amphipods".
---
Июнь 2020. Журнал Limnology and Oceanography (IF 4.3 25, Q1) принял в печать статью с материалами исследования сотрудников НИИ биологии "ИГУ", выполненного совместно с коллегами из университетов США   Ozersky et. al. “Hot and sick? Impacts of warming and a parasite on the dominant zooplankter of Lake Baikal”.
---
Июнь 2020. Журнал Journal of Great Lakes Research (IF 2.17, Q1) опубликовал новую статью с материалами совместного исследования сотрудников НИИ биологии "ИГУ" и их коллег из Института озероведения РАН (Санкт-Петербург) Lubyaga et al. "Invader amphipods Gmelinoides fasciatus (Stebbing, 1899) inhabiting distant waterbodies demonstrate differences in tolerance and energy metabolism under elevated temperatures" 
---
Май 2020.  Журнал Microorganisms  (IF 4.167) опубликовал новую статью с материалами совместного исследования сотрудников НИИ биологии "ИГУ" и их коллег из Института фармакологических исследований им. Гельмгольца (Саарбрюкен, Германия): Voitsekhovskaia et al.  "Baikalomycins A-C, New Aquayamycin-Type Angucyclines Isolated from Lake Baikal Derived Streptomyces sp. IB201691-2A."
---
Апрель 2020. На страницах общественно-политической газеты «Областная» опубликована статья «Байкал – это место для прорывных исследований»  с интервью директора института Максима Тимофеева    о перспективных научных исследованиях, выполняемых учеными НИИ биологии "ИГУ".   
---
Апрель 2020.  Молодые ученые НИИ биологии «ИГУ» получили грантовую поддержку Германской службы академических обменов - DAAD для проведения исследований в ведущих научных центрах Германии в 2020-2021 году. Младший научный сотрудник института, аспирант Анна Назарова получила грант на прохождение стажировки в Центре экологических исследований им. Гельмгольца -UFZ (Лейпциг, Германия).   Младший научный сотрудник института, аспирант Юлия Широкова получила грант на прохождение стажировки в Институте полярных и морских исследований им. Альфреда Вегенера - AWI (также объединение им. Гельмгольца) в г. Бремерхафен.
---
Апрель 2020.   Частный фонд - Фонд "Озеро Байкал" продолжит в 2020 году поддержку выполнения проекту долговременого мониторинга пелагиали озера Байкал - "Точка №1"  (пресс-релиз фонда)
---
Март 2020.   Проекты ученых НИИ биологии ИГУ «Высококонтрастные флуоресцентные микросенсоры в диагностике стрессовых состояний гидробионтов in vivo в реальном времени» (руководитель д.б.н. Максим Тимофеев) и "Разработка подходов к использованию D-лактата для раннего определения патологических процессов, ассоциированных с бактериофлорой, у рыб в аквакультуре"  (руководитель к.б.н. Екатерина Борвинская) получили поддержку Российского научного фонда.
---
Февраль 2020.  Молодые ученые НИИ биологии "ИГУ" сняли видео-экскурсию по лабораториям института. В ходе экскурсии студенты и аспиранты рассказывают о своих исследованиях, делятся впечатлениями и показывают возможности научной базы института. см: "Лаборатория "Проблемы адаптации биосистем" НИИ биологии ИГУ (Иркутск). Экскурсия."
---
Февраль 2020.  Журнал Aquatic Microbial Ecology (Q1, IF 2.02) опубликовал новую статью сотрудников НИИ биологии "ИГУ": Protasov et al. "Freshwater Actinobacteria from sediments of the deep and ancient Lake Baikal (Russia) and their genetic potential as producers of secondary metabolites"
---
Январь 2020.  Журнал Journal of Invertebrate Pathology (IF 2.1, Q1) опубликовал новую статью сотрудников НИИ биологии "ИГУ": Drozdova et al. "The diversity of microsporidian parasites infecting the Holarctic amphipod Gammarus lacustris from the Baikal region is dominated by the genus Dictyocoela"
---
Январь 2020.   Министерство науки и высшего образования РФ поддержало проект НИИ биологии ИГУ «Биотехнологический потенциал Байкала — создание прорывных технологий и продуктов на основе генетических ресурсов уникальных эндемиков озера» под руководством д.б.н. М.А. Тимофеева. В рамках проекта предполагается создание новой научной лаборатории «Лаборатория стресс-физиологии и перспективных биотехнологий» не менее половины научных сотрудников которой составят молодые ученые. 
---

см. весь архив новостей

 

Руководство

Директор -  д.б.н. Тимофеев Максим Анатольевич

Зам. директора по общим вопросам - Парфенова Наталья Сергеевна

Зам. директора по хозяйственным и экономическим вопросам - Шипицына Елена Владимировна

Ученый секретарь - к.б.н. Шимараева Светлана Владимировна