Научно-исследовательский институт биологии

Об институте

русский / english 

   Научно-исследовательский институт биологии Иркутского государственного университета (ранее Биолого-географический институт, БГНИИ) создан в 1923 году постановлением Наркомпроса России. В 2013 институт отметил 90-летний юбилей.  

   С 1920-х гг. в институте работал ряд профессоров, ставших известнейшими иркутскими исследователями, в частности, Б.А. Сварчевский (первый директор БГНИИ), В.Ч. Дорогостайский, С.И. Тимофеев, В.И. Смирнов и др. Виднейшей фигурой в становлении и развитии БГНИИ / НИИ биологии был доктор биологических наук, профессор М.М. Кожов (1890-1968), пришедший в институт в 1925 г. и ставший его директором в 1931 г. Его дочь, доктор биологических наук, профессор О.М. Кожова (1931-2000) руководила институтом в 1971-1981 и 1990-2000 гг. В период с 2002 по 2008 гг. институтом руководила продолжатель научной династии к.б.н. Л.Р.Изместьева (внучка М.М.Кожова). В настоящее время институт возглавляет д.б.н. М.А. Тимофеев.

   В институте 4 лабораторий а также 2 научно-исследовательские группы, в которых работают 5 докторов и 17 кандидатов наук. НИИ биологии проводит научно-исследовательские работы фундаментального и прикладного характера, а также выступает в качестве базы для обучения студентов и аспирантов ИГУ современным методам биологических исследований.

   Главные научные направления института связаны с проведением фундаментальных и прикладных научно-исследовательских работ по изучению структуры и функционирования биоценозов озера Байкал и Байкальской природной территории, оценке их экологического состояния.  Ведущие сотрудники института выполняют исследовательские работы в области экологии и гидробиологии озера Байкал, экофизиологии и молекулярной биологии эндемичных гидробионтов, а также экспериментальной токсикологии и биотехнологии, орнитологии, микробиологии и др.

    Базой для основной части гидробиологических исследований является Байкальская биостанция в пос. Большие Коты. Она состоит из учебных, лабораторных и жилых зданий, музея байкаловедения.  Работы на Байкале ведутся с помощью научно-исследовательского судна "М.М.Кожов".  

   Институт активно участвуют в программах сотрудничества и международных коллаборациях с ведущими научными организациями Беларусии, Украины, Германии, Великобритании, США, Сингапура, Финляндии, Японии и др.  

     В марте 2013 года распоряжением Правительства Российской Федерации N 281-р  группе сотрудников НИИ биологии "ИГУ" присуждена премия Правительства Российской Федерации 2012 года в области науки и техники для молодых ученых и присвоено звание "Лауреат премии Правительства Российской Федерации в области науки и техники для молодых ученых".

 С февраля 1945 года в НИИ биологии "ИГУ" выполняется уникальное по продолжительности мониторинговое исследование байкальского планктона. Проект долговременного мониторинга озера Байкал, известный также как «Точка №1», внесен в Книгу рекордов России как самый длительный проект регулярного экологического мониторинга в истории науки.

 

Последние публикации сотрудников института

 

Pilla, R.M., Williamson, C.E., Adamovich, B.V. et al. Deeper waters are changing less consistently than surface waters in a global analysis of 102 lakes. Sci Rep 10, 20514, 2020 (Q1, IF 3.998).    
     
Bedulina D., P. Drozdova, A. Gurkov, M. Bergen, P.F. Stadler, T. Luckenbach, M. Timofeyev, S. Kalkhof. Proteomics reveals sex-specific heat shock response of Baikal amphipod Eulimnogammarus cyaneus (2020) Science of the Total Environment, doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.143008 (Q1, IF 6.55)  
     
Carrea L., R. I. Woolway, C. J. Merchant, M. T. Dokulil, C. L. DeGasperi, E. de Eyto, S. Kelly, R.S. La Fuente, W. Marszelewski, L. May, A. M. Paterson, M. Pulkkanen, J. A. Rusak, O. Rusanovskaya, S. G. Schladow, M. Schmid, S. V. Shimaraeva, E. A. Silow, M. A. Timofeyev, P. Verburg, S. Watanabe, and G. A. Weyhenmeyer, 2020: Lake surface temperature [in “State of the Climate in 2019”]. Bull. Amer. Meteor. Soc., 101 (8), Si–S429  (Q1, IF - 9.384)  
     
Kochneva, A., Drozdova, P., Borvinskaya, E. The first transcriptomic resource for the flatworm Triaenophorus nodulosus (Cestoda: Bothriocephalidea), a common parasite of holarctic freshwater fish (2020) Marine Genomics, 51,   № 100702 . 
 
     
Drozdova P, Saranchina A, Morgunova M, Kizenko A, Lubyaga Y, Baduev B, Timofeyev M. 2020. The level of putative carotenoid-binding proteins determines the body color in two species of endemic Lake Baikal amphipods. PeerJ 8:e9387 (Q1, IF 2.35)  
     
Burskaia V., S. Naumenko, M. Schelkunov, D. Bedulina, T. Neretina, A. Kondrashov, L. Yampolsky, G.A Bazykin, Excessive parallelism in protein evolution of Lake Baikal amphipod species flock, Genome Biology and Evolution, , evaa138, https://doi.org/10.1093/gbe/evaa138  
     

Ozersky T., Nakov T., Hampton S., Rodenhouse N., Shchapov K., Woo K., Wright K., Pislegina E., Izmesteva L., Silow E., Timofeyev M., Moore M. “Hot and sick? Impacts of warming and a parasite on the dominant zooplankter of Lake Baikal”, Limnology and Oceanography, 2020, V.65, 11,  P. 2772-2786 (IF 4.325, Q1)

 
     
Lubyaga et al. "Invader amphipods Gmelinoides fasciatus (Stebbing, 1899) inhabiting distant waterbodies demonstrate differences in tolerance and energy metabolism under elevated temperatures" Journal of Great Lakes Research (IF 2.17, Q1)  
     
Voitsekhovskaia, I.; Paulus, C.; Dahlem, C.; Rebets, Y.; Nadmid, S.; Zapp, J.; Axenov-Gribanov, D.; Rückert, C.; Timofeyev, M.; Kalinowski, J.; Kiemer, A.K.; Luzhetskyy, A. Baikalomycins A-C, New Aquayamycin-Type Angucyclines Isolated from Lake Baikal Derived Streptomyces sp. IB201691-2A. Microorganisms 2020, 8, 680.  
     
Drozdova, P., Madyarova, E., Dimova, M., Gurkov, A., Vereshchagina, K., Adelshin,R.,  Timofeyev,  M.,  The  diversity  of  microsporidian  parasites  infecting  the  Holarctic  amphipod Gammaruslacustris  from  the  Baikal  region  is  dominated  by  the  genus Dictyocoela, Journal  of  Invertebrate  Pathology (2020),    
     
Protasov ES, Axenov-Gribanov DV, Shatilina ZM, Timofeyev MA, Lane AL (2020) Freshwater Actinobacteria from sediments of the deep and ancient Lake Baikal (Russia) and their genetic potential as producers of secondary metabolites. Aquatic Microbial Ecology 84:1-14.  
     
Protasov, E.S., Axenov-Gribanov, D.V., Rzhechitsky, Y.A. V. A. Emshanova, Y. A. Shirokova, M. A. Timofeyev. Diversity of culturable actinobacteria associated with deepwater endemic amphipods of Lake Baikal and study of their biosynthetic capabilities.  Limnology (2020).    
     

Shatilina Zh., P. Drozdova, D. Bedulina, L. Rivarola-Duarte, S. Schreiber, C. Otto, F. Jühling, S. Aulhorn, W. Busch, Y. Lubyaga, E. Kondrateva, T. Pobezhimova, L. Jakob, M. Lucassen, F. J. Sartoris, J. Hackermüller, H.O. Pörtner, P.F. Stadler, T. Luckenbach (2020) Transcriptome-level effects of the model organic pollutant phenanthrene and its solvent acetone in three amphipod species. Comparative Biochemistry and Physiology - Part D: Genomics and Proteomics. 33,100630  

 
     
P.B. Drozdova, Y.A. Barbitoff, M.V. Belousov, R.K. Skitchenko, T.M. Rogoza, J.Y. Leclercq, A.V. Kajava, A.G. Matveenko, G.A. Zhouravleva, S.A. Bondarev (2020) Estimation of amyloid aggregate sizes with semi-denaturing detergent agarose gel electrophoresis and its limitations, Prion, 14:1, 118-128,
 
     
Axenov-Gribanov, D. V., Bedulina, D. S., Shirokova, Y. A., Emshanova, V. A., Lubyaga, Y. A., Vereshchagina, K. P., Saranchina, A. E., Pobezhimova, T. P., & Timofeyev, M. A. (2019). Diet influence on mechanisms of non-specific stress-response in Baikal endemic amphipod species during long-term laboratory exposure, Crustaceana, 92(11-12), 1349-1368.   

Kochneva A. P. Drozdova, E. Borvinskaya. The first transcriptomic resource for the flatworm Triaenophorus nodulosus (Cestoda: Bothriocephalidea), a common parasite of holarctic freshwater fish. Marine genomics.– 2019.  doi.: 10.1016/j.margen.2019.100702Get

 

M.V. Moore, B.T. Jr. De Stasio, K.N. Huizenga, E.A. Silow. Trophic coupling of the microbial and the classical food web in Lake Baikal, Siberia. Freshwater Biology. – 2019. – V. 64, N 1. – P. 138-151. DOI: 10.1111/fwb.13201. 

 
Drozdova P., Rivarola-Duarte L., D. Bedulina, D. Axenov-Gribanov, S. Schreiber, A. Gurkov, Zh. Shatilina, K. Vereshchagina, Y. Lubyaga, E. Madyarova, C. Otto, F. Jühling, W. Busch, L. Jakob, M. Lucassen, F. J. Sartoris, J. Hackermüller, S. Hoffmann, H.O. Pörtner, T. Luckenbach, M.Timofeyev, P.F. Stadler (2019) Comparison between transcriptomic responses to short-term stress exposures of a common Holarctic and endemic Lake Baikal amphipods. BMC Genomics. Volume 20, Article number: 712    
     
Shchapova, E.; Nazarova, A.; Gurkov, A.; Borvinskaya, E.; Rzhechitskiy, Y.; Dmitriev, I.; Meglinski, I.; Timofeyev, M. Application of PEG-Covered Non-Biodegradable Polyelectrolyte Microcapsules in the Crustacean Circulatory System on the Example of the Amphipod Eulimnogammarus verrucosus. Polymers, 2019, 11, 1246.  
     
A.Gurkov, L.Rivarola-Duarte, D.Bedulina, I.Fernández Casas, H. Michael, P.Drozdova, A.Nazarova, E.Govorukhina, M.Timofeyev, P.F. Stadler, T. Luckenbach (2019) "Indication of ongoing amphipod speciation in Lake Baikal by genetic structures within endemic species". BMC Evolutionary Biology. 19:138
 
     
P. Drozdova, D. Bedulina, E. Madyarova, L. Rivarola-Duarte, S. Schreiber, P. F. Stadler, T. Luckenbach, M. Timofeyev (2019) "Description of strongly heat-inducible heat shock protein 70 transcripts from Baikal endemic amphipods", Scientific reports, 9,  8907   
     

M.V. Moore, B.T. De Stasio Jr., K.N. Huizenga, E.A. Silow (2018) Trophic coupling of the microbial and the classical food web in Lake Baikal, Siberia. Freshwater Biology. DOI: 10.1111/fwb.13201

 
     
Vereshchagina K.P., Kondrateva E.S., Axenov-Gribanov D.V., Shatilina Zh.M.,Khomich A.S., Bedulina D.S., Zadereev E. S., Timofeyev M.A. (2018) Nonspecific stress response to temperature increase in Gammarus lacustris Sars with respect to oxygen-limited thermal tolerance concept. PeerJ 6:e5571  
 
     

Voytsekhovskaya IV, Axenov-Gribanov DV, Murzina SA, Pekkoeva SN, Protasov ES, Gamaiunov SV, Timofeyev MA. (2018) Estimation of antimicrobial activities and fatty acid composition of actinobacteria isolated from water surface of underground lakes from Badzheyskaya and Okhotnichya caves in Siberia. PeerJ 6:e5832  

 
     
R. I. Woolway, L. Carrea, C. J. Merchant, M. T. Dokulil, E. de Eyto, C. L. DeGasperi, J. Korhonen, W. Marszelewski, L. May, A. M. Paterson, A. Rimmer, J. A. Rusak, S. G. Schladow, M. Schmid, S. V. Shimaraeva, E. A. Silow, M. A. Timofeyev, P. Verburg, S. Watanabe, and G. A. Weyhenmeyer, 2018: Lake surface temperature [in “State of the Climate in 2017”]. Bull. Amer. Meteor. Soc., 99 (8), S13–S15, doi:10.1175/2018BAMSStateoftheClimate.1.  
     
Dimova M., Madyarova E., Gurkov A., Drozdova P., Lubyaga Y., Kondrateva E., Adelshin R., Timofeyev M.  Genetic diversity of Microsporidia in the circulatory system of endemic amphipods from different locations and depths of ancient Lake Baikal. 2018.  PeerJ 6:e5329
 
     
Borvinskaya, E., Gurkov, A., Shchapova, E., Karnaukhov, D., Sadovoy, A., Meglinski, I., Timofeyev, M. Simple and Effective Administration and Visualization of Microparticles in the Circulatory System of Small Fishes Using Kidney Injection. J. Vis. Exp. (136), e57491, doi:10.3791/57491 (2018).  
     
Bowman, L. L., Kondrateva, E. S., Timofeyev, M. A. and Yampolsky, L. Y. (2018), Temperature gradient affects differentiation of gene expression and SNP allele frequencies in the dominant Lake Baikal zooplankton species. Molecular ecology.  doi:10.1111/mec.14704  
     
Gurkov, A., Borvinskaya, E., Shchapova, E., Timofeyev, M.  Restraining small decapods and amphipods for in vivo laboratory studies (2018) Crustaceana, 91 (5), pp. 517-525. 
 
     
Borvinskaya, E., Gurkov, A., Shchapova, E., Baduev, B., Meglinski, I., Timofeyev, M. Distribution of PEG-coated hollow polyelectrolyte microcapsules after introduction into the circulatory system and muscles of zebrafish (2018) Biology Open, 7 (1), статья № bio030015, .   
     
Shchapova, E.P., Axenov-Gribanov, D.V., Lubyaga, Y.A., Shatilina, Z.M., Vereshchagina, K.P., Madyarova, E.V., Protasov, E.S., Timofeyev, M.A. Crude oil at concentrations considered safe promotes rapid stress-response in Lake Baikal endemic amphipods (2018) Hydrobiologia, 805 (1), pp. 189-201.   
     
Protasov, E.S., Axenov-Gribanov, D.V., Rebets, Y.V., Voytsekhovskaya, I.V., Tokovenko, B.T., Shatilina, Z.M., Luzhetskyy, A.N., Timofeyev, M.A. The diversity and antibiotic properties of actinobacteria associated with endemic deepwater amphipods of Lake Baikal (2017) Antonie van Leeuwenhoek, International Journal of General and Molecular Microbiology, 110 (12), pp. 1593-1611.  
     
Borvinskaya E., Gurkov A., Shchapova E., Baduev B., Meglinski I., Timofeyev M.  Distribution of PEG-coated hollow polyelectrolyte microcapsules after introduction into the circulatory system and muscles of zebrafish. Biology Open 2018. 7: bio030015      
     
Hampton S.E,…, Silow E.A.,…, Timofeyev M.A., et al. Ecology under lake ice. Ecology letters, (2017) 20: 98–111  
     
Timofeyev M.A., Silow E.A., Mackay A.W., Moore M.V., Likens G.E. (2016) Safeguarding the world’s largest lake. Nature. Vol.538, № 7623, pp. 41  
 
 
 
Sharma, S… L.R. Izmest’eva, E.A. Silow… et al. A global database of lake surface temperatures collected by in situ and satellite methods from 1985–2009. Scientific Data (Nature Publishing Group) 2:150008 doi: 10.1038/sdata.2015.8.
 
 

Новости

Ноябрь 2020.  В журнале Scientific Reports (Q1, IF 3.998) опубликована статья Pilla et al. "Deeper waters are changing less consistently than surface waters in a global analysis of 102 lakes"  с результатами глобального анализа данных, полученных в ходе долговременного мониторинга 102 озёр, расположенных в 18-ти странах на 5-ти континентах. Авторский колектив состоит из 57 авторов, представляющих более 50 научных организаций из 22-х стран, в том числе четверых сотрудников НИИ биологии "ИГУ". 
---
Ноябрь 2020. Молодые ученые НИИ биологии «ИГУ» аспиранты Юлия Широкова  и Елизавета Кондратьева удостоены Именными стипендиями Губернатора Иркутской области 2020 года.
---
Ноябрь 2020. На официальном портале "Российско-Германского года научно-образовательных партнерств 2018-2020" опубликовано интервью директора НИИ биологии "ИГУ" д.б.н. Максима Тимофеева, посвященное опыту сотрудничеству и построения многолетних устойчивых связей с ведущими научными организациями Германии.  см: "Интерес к Российско-Германскому научному сотрудничеству растет"
---
Октябрь 2020.  Журнал Science of the Total Environment (Q1, IF 6.55) опубликовал новую статью сотрудников  НИИ биологии "ИГУ":  D. Bedulina, P.  et al., Proteomics reveals sex-specific heat shock response of Baikal amphipod Eulimnogammarus cyaneus
---
Октябрь 2020. Молодые ученые НИИ биологии ИГУ приняли участие в 24-ой Международной Пущинской школе-конференции "Биология - наука XXI века", которая проходила 5-7 октября 2020 г. в городе Пущино. 
 
На конференции был представлен устный доклад аспиранта Золотовской Елены на тему «Поиск низкомолекулярных природных соединений с антимикробными свойствами в гемолимфе байкальских амфипод Eulimnogammarus verrucosus». В рамках постерной сессии студенты Мутин Андрей и Саранчина Александра представили доклады "Влияние длительной акклимации при пониженных температурах на физиологические параметры байкальских и голарктических амфипод" и "Сравнительная характеристика формирования окраса эндемичных амфипод озера Байкал Eulimnogammarus cyaneus и E. vittatus".  По результатам конференции доклад Золотовской Елены был удостоен диплома первой степени на секции «Экология».
---
Сентябрь 2020. Проект «Биопереработка органических отходов на природной территории оз. Байкал с использованием насекомых-редуцентов» (руководитель мнс НИИ биологии "ИГУ" Максим Дагбаев), победил в номинации «Прикладные научные исследования и научно-техническая деятельность на особо охраняемых природных территориях» грантового конкурса "Байкальская иннициатива" фонда поддержки прикладных экологических разработок и исследований «Озеро Байкал».
---
Сентябрь 2020.  Молодые ученые НИИ биологии «ИГУ» удостоены именных стипендий. Уже третий год подряд аспирантке Екатерине Щаповой присуждены сразу две стипендии: Правительства РФ и Президента РФ. Стипендия Правительства РФ по приоритетным направлениям (для аспирантов) присуждена Юлии Широковой.  
---

Август 2020. Опубликован  международный отчет «State of the Climate 2019» с результатами научной оценки состояния климата нашей планеты.  Выпуск глобального отчета, издаваемого Американским метеорологическим обществом, выпускается в качестве специального приложения к журналу «Bulletin of American Meteorological Society» (Q1, Impact factor - 9.384). Это уже тридцатый ежегодный отчёт. Вот уже в третий раз в этот глобальный отчет включаются данные наблюдений, полученных в рамках проекта долговременного экологического мониторинга озера Байкал – «Точка №1», выполняемого учеными НИИ биологии ИГУ при поддержке Минобрнауки и Фонда «Озеро Байкал». Этот мониторинг осуществляется с 1945 г. и является самым длительным на сегодня примером экологического мониторинга планктонных сообществ в мире.  

В текущий отчет сведены результаты работы 528 исследователей из 61 страны мира, осуществляющих наблюдения за состоянием глобальных климатических процессов, а также сделана оценка последствий событий, происходящих в атмосфере планеты, в океанах и на континентах.  
---
Август 2020. 4 августа в диссертационном совете Института биологии внутренних вод имени И. Д. Папанина РАН состоялась успешная защита диссертаций на соискание степени кандидата биологических наук двух научных сотрудников НИИ биологии «ИГУ» - Верещагиной Ксении Петровны (диссертация на тему «Влияние длительной холодовой и тепловой акклимации на неспецифический стресс-ответ и энергетический метаболизм байкальских эндемичных и голарктических амфипод») и Гуркова Антона Николаевича (диссертация на тему «Исследование вариабельности pH внутренних сред гидробионтов в стрессовых условиях in vivo»)
---
Июль 2020. На странице научно-информационного портала N+1 опубликованы комментарии директора НИИ биологии "ИГУ" д.б.н. Максима Тимофеева относительно серии недавних сообщений в центральных СМИ о "стремительной потери прозрачности" вод озера Байкал.  см: "Мутнеет ли Байкал?"
---
Июль 2020.  Журнал Genome Biology and Evolution (Q2, IF 3.462) принял в печать новую статью с участием сотрудников  НИИ биологии "ИГУ": Burskaia et al. "Excessive parallelism in protein evolution of Lake Baikal amphipod species flock"
---
Июль 2020. Молодые ученые НИИ биологии "ИГУ" Ярослав Ржечицкий и Дмитрий Карнаухов победители конкурса грантов для поддержки НИР аспирантов и молодых сотрудников ИГУ.
---

Июнь 2020. На страницах научно-популярного портала "Индикатор" вышла статья о проводимых в НИИ биологии ИГУ исследованиях. См: "Пеструю окраску байкальским рачкам придают белки, которые у других отвечают за распознавание запахов".

---
Июнь 2020.  Журнал PeerJ (Q1, IF 2.35) опубликовал новую статью сотрудников  НИИ биологии "ИГУ": Drozdova et al.  "The level of putative carotenoid-binding proteins determines the body color in two species of endemic Lake Baikal amphipods".
---
Июнь 2020. Журнал Limnology and Oceanography (IF 4.3 25, Q1) принял в печать статью с материалами исследования сотрудников НИИ биологии "ИГУ", выполненного совместно с коллегами из университетов США   Ozersky et. al. “Hot and sick? Impacts of warming and a parasite on the dominant zooplankter of Lake Baikal”.
---
Июнь 2020. Журнал Journal of Great Lakes Research (IF 2.17, Q1) опубликовал новую статью с материалами совместного исследования сотрудников НИИ биологии "ИГУ" и их коллег из Института озероведения РАН (Санкт-Петербург) Lubyaga et al. "Invader amphipods Gmelinoides fasciatus (Stebbing, 1899) inhabiting distant waterbodies demonstrate differences in tolerance and energy metabolism under elevated temperatures" 
---
Май 2020.  Журнал Microorganisms  (IF 4.167) опубликовал новую статью с материалами совместного исследования сотрудников НИИ биологии "ИГУ" и их коллег из Института фармакологических исследований им. Гельмгольца (Саарбрюкен, Германия): Voitsekhovskaia et al.  "Baikalomycins A-C, New Aquayamycin-Type Angucyclines Isolated from Lake Baikal Derived Streptomyces sp. IB201691-2A."
---

см. весь архив новостей

 

Руководство

Директор -  д.б.н. Тимофеев Максим Анатольевич

Зам. директора по общим вопросам - Парфенова Наталья Сергеевна

Зам. директора по хозяйственным и экономическим вопросам - Шипицына Елена Владимировна

Ученый секретарь - к.б.н. Шимараева Светлана Владимировна