Научно-исследовательский институт биологии

Об институте

русский / english 

   Научно-исследовательский институт биологии Иркутского государственного университета (ранее Биолого-географический институт, БГНИИ) создан в 1923 году постановлением Наркомпроса России. В 2023 институт отметил 100-летний юбилей.  

   С 1920-х гг. в институте работал ряд профессоров, ставших известнейшими иркутскими исследователями, в частности, Б.А. Сварчевский (первый директор БГНИИ), В.Ч. Дорогостайский, С.И. Тимофеев, В.И. Смирнов и др. Виднейшей фигурой в становлении и развитии БГНИИ / НИИ биологии был доктор биологических наук, профессор М.М. Кожов (1890-1968), пришедший в институт в 1925 г. и ставший его директором в 1931 г. Его дочь, доктор биологических наук, профессор О.М. Кожова (1931-2000) руководила институтом в 1971-1981 и 1990-2000 гг. В период с 2002 по 2008 гг. институтом руководила продолжатель научной династии к.б.н. Л.Р.Изместьева (внучка М.М.Кожова). С 2013 года  институт возглавляет д.б.н. М.А. Тимофеев.

   В институте 5 лабораторий а также 2 научно-исследовательские группы, в которых работают 6 докторов и 14 кандидатов наук. НИИ биологии проводит научно-исследовательские работы фундаментального и прикладного характера, а также выступает в качестве базы для обучения студентов и аспирантов ИГУ современным методам биологических исследований.

   Главные научные направления института связаны с проведением фундаментальных и прикладных научно-исследовательских работ по изучению структуры и функционирования биоценозов озера Байкал и Байкальской природной территории, оценке их экологического состояния.  Ведущие сотрудники института выполняют исследовательские работы в области экологии и гидробиологии озера Байкал, экофизиологии и молекулярной биологии эндемичных гидробионтов, а также экспериментальной токсикологии и биотехнологии, орнитологии, микробиологии и др.

    Базой для основной части гидробиологических исследований является Байкальская биостанция в пос. Большие Коты. Она состоит из учебных, лабораторных и жилых зданий, музея байкаловедения.  Работы на Байкале ведутся с помощью научно-исследовательского судна "М.М.Кожов".  

   Институт активно участвуют в программах сотрудничества и международных коллаборациях с ведущими научными организациями Беларусии, Украины, Германии, Великобритании, США, Сингапура, Финляндии, Японии и др.  

     В марте 2013 года распоряжением Правительства Российской Федерации N 281-р  группе сотрудников НИИ биологии "ИГУ" присуждена премия Правительства Российской Федерации 2012 года в области науки и техники для молодых ученых и присвоено звание "Лауреат премии Правительства Российской Федерации в области науки и техники для молодых ученых".

 С февраля 1945 года в НИИ биологии "ИГУ" выполняется уникальное по продолжительности мониторинговое исследование байкальского планктона. Проект долговременного мониторинга озера Байкал, известный также как «Точка №1», внесен в Книгу рекордов России как самый длительный проект регулярного экологического мониторинга планктона в истории науки.

 

Последние публикации сотрудников института

Дроздова П.Б., Мадьярова Е.В., Гурков А.Н., Саранчина А.Е., Романова Е.В., Петунина Ж.В., Перетолчина Т.Е., Щербаков Д.Ю., Тимофеев М.А. Байкальские амфиподы и их геномы, большие и малые. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2024;28(3):317-325. (Q2)   
     
Nazarova A, Mutin A, Skafar D, Bolbat N, Sedova S, Chupalova P, Pomazkin V, Drozdova P, Gurkov A, Timofeyev M. 2024. Leeches Baicalobdella torquata feed on hemolymph but have a low effect on the cellular immune response of amphipod Eulimnogammarus verrucosus from Lake Baikal. PeerJ 12:e17348 (IF 2.7, Q1)  
     
Thermal tolerance of a freshwater amphipod Gammarus lacustris can be enhanced by acclimation to higher mineralization.  Kondrateva, E., Vereshchagina, K.,  Mutin, A.,  Timofeyev, M. Comparative Biochemistry and Physiology -Part A : Molecular and Integrative Physiology , 2024, 292, 111622 (IF 2.3, Q1)  
     
Drozdova P, Gurkov A, Saranchina A, Vlasevskaya A, Zolotovskaya E, Indosova E, Timofeyev M, Borvinskaya E. Transcriptional response of Saccharomyces cerevisiae to lactic acid enantiomers. Appl Microbiol Biotechnol. 2024 Dec;108(1):121. doi: 10.1007/s00253-023-12863-z. (IF 5, Q1)  
     
L. Carrea, C.J. Merchant, J.-F. Creatux, T.M. Dokulil, H.A. Dugan, B. Gibbes, A. Laas, E.M. Leibensperger, S. Maberly, L. May, S.-I. Matsuzaki, G. Monet, D. Pierson, M. Pulkkanen, O.O. Rusanovskaya, S.V. Shimaraeva, E.A. Silow, M. Schmid, M.A. Timofeyev, P. Verburg, and R. I. Woolway, 2023: Lake surface temperature [in “State of the Climate in 2022”]. Bull. Amer. Meteor. Soc., 104 (9), Si–S501   (IF 8.77, Q1)  
     
Borvinskaya E., Matrosova S., Sukhovskaya I., Drozdova P., Titov  E., Anikienko I., Lubyaga Y., Gurkov A., Timofeyev M. Tissue Reaction to Low-Density Polyacrylamide Gel as a Carrier for Mi-croimplants in the Adipose Fin of Rainbow Trout. Gels 2023, 9, 629. (IF 4.6, Q1)  
     

Lubyaga Y, Yarinich L, Drozdova P, Pindyurin A, Gurkov A, Luckenbach T, Timofeyev M. The ABCs of the amphipod P-glycoprotein: Heterologous production of the Abcb1 protein of a model species Eulimnogammarus verrucosus (Amphipoda: Gammaridae) from Lake Baikal. Comparative Biochemistry and Physiology Part C: Toxicology & Pharmacology. 2023 9:109677. (IF 4.5, Q1)

 
     
Nazarova, A.; Gurkov, A.; Rzhechitskiy, Y.; Shchapova, E.; Mutin, A.; Saranchina, A.; Diagileva, A.; Bolbat, N.; Krivoshapkin, P.; Timofeyev, M. Turn a Shrimp into a Firefly: Monitoring Tissue pH in Small Crustaceans Using an Injectable Hydrogel Sensor with Infrared Excitation and Visible Luminescence. Photonics 2023, 10, 697. (IF 2.5, Q2)  
     

Martemyanov V.,  Akhanaev Y.,  Belousova I., Pavlusin S.,  Yakimova M.,  Kharlamova D.,  Ageev A., Golovina A.,  Astapenko S.,  Kolosov A., Ananko G., Taranov O.,  Shvalov A., Bodnev S., Ershov N.,  Grushevaya I., Timofeyev M., Tokarev S. (2023) Microbiology Spectrum, doi: 10.1128/spectrum.03855-22  (IF 9.02, Q1)

 
     
Fontaneto D., E. Sottoriva, A. Rodríguez-Gijón, D. Bedulina, A. Gurkov, O. A. Timoshkin & V. N. Ivanenko (2023) Limited diversity of epibiont bdelloid rotifers and no pattern of codiversification with the highly diverse endemic amphipods of a coastal zone of Lake Baikal, The European Zoological Journal, 90:1, 354-365 (IF 1.6, Q2)  
     
Rzhechitskiy, Y.; Gurkov, A.; Bolbat, N.; Shchapova, E.; Nazarova, A.; Timofeyev, M.; Borvinskaya, E. Adipose Fin as a Natural “Optical Window” for Implantation of Fluorescent Sensors into Salmonid Fish. Animals 2022, 12, 3042. (IF 3.23, Q1)  
     
Shchapova E, Titov E, Gurkov A, Nazarova A, Borvinskaya E, Timofeyev M. Durability of Implanted Low-Density Polyacrylamide Hydrogel Used as a Scaffold for Microencapsulated Molecular Probes inside Small Fish. Polymers. 2022; 14(19):3956. (IF 4.96, Q1)  
     

Meyer F.,  T. Ozersky, K.H. Woo, K. Shchapov, A.W.E. Galloway, J.B. Schram, E.J. Rosi, D.D. Snow, M.A. Timofeyev, D.Yu. Karnaukhov, M.R. Brousil, S.E. Hampton.  Effects of spatially heterogeneous lakeside development on nearshore biotic communities in a large, deep, oligotrophic lake. Limnology and oceanography, 2022 (IF 4.9, Q1)

 
     
Drozdova, P.; Saranchina, A.; Madyarova, E.; Gurkov, A.; Timofeyev, M. Experimental Crossing Confirms Reproductive Isolation between Cryptic Species within Eulimnogammarus verrucosus (Crustacea: Amphipoda) from Lake Baikal. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 10858 (IF 6.2, Q1)  
     
Madyarova, E.; Shirokova, Y.; Gurkov, A.; Drozdova, P.; Baduev, B.; Lubyaga, Y.; Shatilina, Z.; Vishnevskaya, M.; Timofeyev, M. Metabolic Tolerance to Atmospheric Pressure of Two Freshwater Endemic Amphipods Mostly Inhabiting the Deep-Water Zone of the Ancient Lake Baikal. Insects 2022, 13, 578 (IF 3.1, Q1)  
     
Popov A., Timofeyev M., Bykov A., Meglinski I. “Luminescent upconversion nanoparticles evaluating temperature-induced stress experienced by aquatic organisms owing to environmental variations”, iScience, 2022, 25, 104568 (IF 6.1, Q1)  
     

Morozov A, Vasileva A, Chechkova N, Kuchko T, Borvinskaya E, Sukhovskaya I. SSU rRNA sequencing data for bacterial communities associated with Vibrio-infected rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Data Brief. 2022 Nov 13;45:108752. doi: 10.1016/j.dib.2022.108752.  

 
     
Karnaukhov, D., Biritskaya, S., Dolinskaya, Okholina, A., Silow, E. Distribution Features of Microplastic Particles in the Bolshiye Koty Bay (Lake Baikal, Russia) in Winter, Pollution, 2022, 8(2), стр. 435–446 
 
     
Meyer, M.F., Ozersky, T., Woo, K.H., K.Shchapov, A. Galloway, J. Schram, D. Snow, M. Timofeyev, D. Karnaukhov, M. Brousil, Hampton S.E.  A unified dataset of colocated sewage pollution, periphyton, and benthic macroinvertebrate community and food web structure from Lake Baikal (Siberia).   Limnology And Oceanography Letters, 2022, 7(1), стр. 62–79 (Q1, IF 7,78)
 
     
Gatter T., S. Löhneysen, J. Fallmann, P. Drozdova, T. Hartmann, Stadler P.F.  LazyB: fast and cheap genome assembly. Algorithms for Molecular Biology, 2021, volume 16, Article number: 8 (IF 1.4)   
     
Hrycik AR, Isles PDF, Adrian R, Albright M, Bacon LC, Berger SA, Bhattacharya R, Grossart HP, Hejzlar J, Hetherington AL, Knoll LB, Laas A, McDonald CP, Merrell K, Nejstgaard JC, Nelson K, Nõges P, Paterson AM, Pilla RM, Robertson DM, Rudstam LG, Rusak JA, Sadro S, Silow EA, Stockwell JD, Yao H, Yokota K, Pierson DC. Earlier winter/spring runoff and snowmelt during warmer winters lead to lower summer chlorophyll-a in north temperate lakes. Glob Chang Biol. 2021 Oct;27(19):4615-4629. (IF 13.2, Q1)  
     
Borvinskaya, E., Kochneva, A., Bedulina, D., Smirnov, L., Babkina, I. Comparative Analysis of Proteins of Functionally Different Body Parts of the Fish Parasites Triaenophorus nodulosus and Triaenophorus crassus.  2021, Acta Parasitologica, 66(4), стр. 1137–1150 (IF 1.4)
 
     
Meyer, M.F., Ozersky, T., Woo, K.H., Shchapov, K., Galloway, A.W.E., Schram, J.B., Snow, D.D., Timofeyev, M.A., Karnaukhov, D.Y., Brousil, M.R. and Hampton, S.E. (2021), A unified dataset of colocated sewage pollution, periphyton, and benthic macroinvertebrate community and food web structure from Lake Baikal (Siberia). Limnology and Oceanography Letters (Q1, IF 7.8)  
     
Lipaeva, P., Vereshchagina, K., Drozdova, P., Jakob, L., Kondrateva, E., Lucassen, M., Bedulina, D., Timofeyev, M., Stadler, P., & Luckenbach, T. (2021). Different ways to play it cool: Transcriptomic analysis sheds light on different activity patterns of three amphipod species under long-term cold exposure. Molecular Ecology, 00, 1– 17. https://doi.org/10.1111/mec.16164 (Q1, IF 6.1)  
     
Barbitoff, Y. A., Matveenko, A. G., Matiiv, A. B., Maksiutenko, E. M., Moskalenko, S. E., Drozdova, P. B., Polev, D. E., Beliavskaia, A. Y., Danilov, L. G., Predeus, A. V., & Zhouravleva, G. A. (2021). Chromosome-level genome assembly and structural variant analysis of two laboratory yeast strains from the Peterhof Genetic Collection lineage. G3 (Bethesda, Md.), 11(4), jkab029. (Q1, IF 2.7)  
     
Bedulina D., Drozdova P., Gurkov A., M.Bergen, P.F. Stadler, T. Luckenbach, M. Timofeyev, S. Kalkhof. . Proteomics reveals sex-specific heat shock response of Baikal amphipod Eulimnogammarus cyaneus, Science of The Total Environment, Volume 763, 143008 (2021) (Q1, IF 7.9)
 
     
Pilla, R.M., Mette, E.M., Williamson, C.E.,.. H.V. Pislegina,.. O.O. Rusanovskaya,... S.V. Shimaraeva, Eugene A. Silow,.. M.A. Timofeyev et al. Global data set of long-term summertime vertical temperature profiles in 153 lakes. Scientific Data (Nature Publishing Group)8, 200  (2021) (Q1, IF 5.5)  
     
Shchapova, E., Nazarova, A., Vasilyeva, U. et al. Cellular Immune Response of an Endemic Lake Baikal Amphipod to Indigenous Pseudomonas sp. Marine Biotechnology (2021).  (Q1, IF 3.4)  
     
Kraemer, B.M., Pilla, R.M., Woolway, R.I... Silow, E.A.... Timofeyev, M.A... et al. Climate change drives widespread shifts in lake thermal habitat. Nature Climate Change (2021).  (Q1, IF 20.893)  
     
Vereshchagina, K., Kondrateva, E., Mutin, A. et al. Low annual temperature likely prevents the Holarctic amphipod Gammarus lacustris from invading Lake Baikal. Sci Rep 11, 10532 (2021). (Q1, IF 3.998)  
     
Drozdova, P., Kizenko, A., Saranchina, A. et al. The diversity of opsins in Lake Baikal amphipods (Amphipoda: Gammaridae). BMC Ecol Evo 21, 81 (2021). (Q1, IF 3.045)  
     
Karnaukhov, D., Teplykh, M., Dolinskaya, D.,  Biritskaya S., Ermolaeva Y., Viktoria Pushnica, I. Kuznetsova, Bukhaeva, L., Silow, E.  Light pollution affects the coastal zone of Lake Baikal (2021) Limnological Review, 21(3), стр. 165–168
 
     
Karnaukhov DYu, Dolinskaya EM, Biritskaya SA, Teplykh MA, Ermolaeva YK, Pushnica VA, Kuznetsova IV, Okholina AI, Bukhaeva LB, Rusanovskaya OO, Silow EA (2021) New data regarding ecology of freshwater pelagic amphipod Macrohectopus branickii and other crustaceans of plankton from the southern part of Lake Baikal. Acta Biologica Sibirica 7: 39-48.  
     
Pekkoeva, S.N., Voronin, V.P., Shatilina, Z.M. Madyarova E.V.,  Axenov-Gribanov D.V.,  Shirokova Y.A., Timofeyev M.A., Nemova N.N., Murzina S.A. Lipid and fatty acid composition of scavenging amphipods Ommatogammarus spp. from different depths of lake Baikal. Limnology (2021). (Q2, IF 1.625)  
     
Borvinskaya E, Gurkov A, Shchapova E, Mutin A, Timofeyev M. 2021. Histopathological analysis of zebrafish after introduction of non-biodegradable polyelectrolyte microcapsules into the circulatory system. PeerJ 9:e11337 (Q2, IF 2.38)  
     
Brown KP, Gerber A, Bedulina D, Timofeyev MA. Human impact and ecosystemic health at Lake Baikal. Wiley Interdisciplinary Reviews: Water. 2021; e1528. (Q1, IF 4.4).  
     
Jakob, L., Vereshchagina, K.P., Tillmann, A. et al. Thermal reaction norms of key metabolic enzymes reflect divergent physiological and behavioral adaptations of closely related amphipod species. Sci Rep 11, 4562 (2021). (Q1, IF 3.998)  
     
S.Wollrab, L.Izmest’yeva, S.E.Hampton, E.A.Silow, E.Litchman, C.A. Klausmeier. Climate Change–Driven Regime Shifts in a Planktonic Food Web. The American Naturalist, 2021, https://doi.org/10.1086/712813 (Q1, IF 4.265)
 
     
Pilla, R.M., Williamson, C.E., Adamovich, B.V. et al. Deeper waters are changing less consistently than surface waters in a global analysis of 102 lakes. Sci Rep 10, 20514, 2020 (Q1, IF 3.998).    
     
Carrea L., R. I. Woolway, C. J. Merchant, M. T. Dokulil, C. L. DeGasperi, E. de Eyto, S. Kelly, R.S. La Fuente, W. Marszelewski, L. May, A. M. Paterson, M. Pulkkanen, J. A. Rusak, O. Rusanovskaya, S. G. Schladow, M. Schmid, S. V. Shimaraeva, E. A. Silow, M. A. Timofeyev, P. Verburg, S. Watanabe, and G. A. Weyhenmeyer, 2020: Lake surface temperature [in “State of the Climate in 2019”]. Bull. Amer. Meteor. Soc., 101 (8), Si–S429  (Q1, IF - 9.384)  
     
Kochneva, A., Drozdova, P., Borvinskaya, E. The first transcriptomic resource for the flatworm Triaenophorus nodulosus (Cestoda: Bothriocephalidea), a common parasite of holarctic freshwater fish (2020) Marine Genomics, 51,   № 100702 . (IF 1.9)
 
     
Drozdova P, Saranchina A, Morgunova M, Kizenko A, Lubyaga Y, Baduev B, Timofeyev M. 2020. The level of putative carotenoid-binding proteins determines the body color in two species of endemic Lake Baikal amphipods. PeerJ 8:e9387 (Q1, IF 2.35)  
     
Burskaia V., S. Naumenko, M. Schelkunov, D. Bedulina, T. Neretina, A. Kondrashov, L. Yampolsky, G.A Bazykin, Excessive parallelism in protein evolution of Lake Baikal amphipod species flock, Genome Biology and Evolution, evaa138. (IF 3.4, Q1)  
     

Ozersky T., Nakov T., Hampton S., Rodenhouse N., Shchapov K., Woo K., Wright K., Pislegina E., Izmesteva L., Silow E., Timofeyev M., Moore M. “Hot and sick? Impacts of warming and a parasite on the dominant zooplankter of Lake Baikal”, Limnology and Oceanography, 2020, V.65, 11,  P. 2772-2786 (IF 4.325, Q1)

 
     
Lubyaga et al. "Invader amphipods Gmelinoides fasciatus (Stebbing, 1899) inhabiting distant waterbodies demonstrate differences in tolerance and energy metabolism under elevated temperatures" Journal of Great Lakes Research (IF 2.17,Q1)  
     
Voitsekhovskaia, I.; Paulus, C.; Dahlem, C.; Rebets, Y.; Nadmid, S.; Zapp, J.; Axenov-Gribanov, D.; Rückert, C.; Timofeyev, M.; Kalinowski, J.; Kiemer, A.K.; Luzhetskyy, A. Baikalomycins A-C, New Aquayamycin-Type Angucyclines Isolated from Lake Baikal Derived Streptomyces sp. IB201691-2A. Microorganisms 2020, 8, 680. (IF 4.9, Q2)  
     
Drozdova, P., Madyarova, E., Dimova, M., Gurkov, A., Vereshchagina, K., Adelshin,R.,  Timofeyev,  M.,  The  diversity  of  microsporidian  parasites  infecting  the  Holarctic  amphipod Gammaruslacustris  from  the  Baikal  region  is  dominated  by  the  genus Dictyocoela, Journal  of  Invertebrate  Pathology, 2020 (IF 2.8, Q2)    
     
Protasov ES, Axenov-Gribanov DV, Shatilina ZM, Timofeyev MA, Lane AL (2020) Freshwater Actinobacteria from sediments of the deep and ancient Lake Baikal (Russia) and their genetic potential as producers of secondary metabolites. Aquatic Microbial Ecology 84:1-14. (IF 1.6, Q3)  
     
Protasov, E.S., Axenov-Gribanov, D.V., Rzhechitsky, Y.A. V. A. Emshanova, Y. A. Shirokova, M. A. Timofeyev. Diversity of culturable actinobacteria associated with deepwater endemic amphipods of Lake Baikal and study of their biosynthetic capabilities.  Limnology, 2020 (IF 1.5)    
     

Shatilina Zh., P. Drozdova, D. Bedulina, L. Rivarola-Duarte, S. Schreiber, C. Otto, F. Jühling, S. Aulhorn, W. Busch, Y. Lubyaga, E. Kondrateva, T. Pobezhimova, L. Jakob, M. Lucassen, F. J. Sartoris, J. Hackermüller, H.O. Pörtner, P.F. Stadler, T. Luckenbach (2020) Transcriptome-level effects of the model organic pollutant phenanthrene and its solvent acetone in three amphipod species. Comparative Biochemistry and Physiology - Part D: Genomics and Proteomics. 33,100630  (IF 2.6, Q1)

 
     
P.B. Drozdova, Y.A. Barbitoff, M.V. Belousov, R.K. Skitchenko, T.M. Rogoza, J.Y. Leclercq, A.V. Kajava, A.G. Matveenko, G.A. Zhouravleva, S.A. Bondarev (2020) Estimation of amyloid aggregate sizes with semi-denaturing detergent agarose gel electrophoresis and its limitations, Prion, 14:1, 118-128,
 
     
Axenov-Gribanov, D. V., Bedulina, D. S., Shirokova, Y. A., Emshanova, V. A., Lubyaga, Y. A., Vereshchagina, K. P., Saranchina, A. E., Pobezhimova, T. P., & Timofeyev, M. A. (2019). Diet influence on mechanisms of non-specific stress-response in Baikal endemic amphipod species during long-term laboratory exposure, Crustaceana, 92(11-12), 1349-1368.   

Kochneva A. P. Drozdova, E. Borvinskaya. The first transcriptomic resource for the flatworm Triaenophorus nodulosus (Cestoda: Bothriocephalidea), a common parasite of holarctic freshwater fish. Marine genomics.– 2019.  doi.: 10.1016/j.margen.2019.100702Get

 

M.V. Moore, B.T. Jr. De Stasio, K.N. Huizenga, E.A. Silow. Trophic coupling of the microbial and the classical food web in Lake Baikal, Siberia. Freshwater Biology. – 2019. – V. 64, N 1. – P. 138-151. DOI: 10.1111/fwb.13201. 

 
Drozdova P., Rivarola-Duarte L., D. Bedulina, D. Axenov-Gribanov, S. Schreiber, A. Gurkov, Zh. Shatilina, K. Vereshchagina, Y. Lubyaga, E. Madyarova, C. Otto, F. Jühling, W. Busch, L. Jakob, M. Lucassen, F. J. Sartoris, J. Hackermüller, S. Hoffmann, H.O. Pörtner, T. Luckenbach, M.Timofeyev, P.F. Stadler (2019) Comparison between transcriptomic responses to short-term stress exposures of a common Holarctic and endemic Lake Baikal amphipods. BMC Genomics. Volume 20, Article number: 712    
     
Shchapova, E.; Nazarova, A.; Gurkov, A.; Borvinskaya, E.; Rzhechitskiy, Y.; Dmitriev, I.; Meglinski, I.; Timofeyev, M. Application of PEG-Covered Non-Biodegradable Polyelectrolyte Microcapsules in the Crustacean Circulatory System on the Example of the Amphipod Eulimnogammarus verrucosus. Polymers, 2019, 11, 1246.  
     
A.Gurkov, L.Rivarola-Duarte, D.Bedulina, I.Fernández Casas, H. Michael, P.Drozdova, A.Nazarova, E.Govorukhina, M.Timofeyev, P.F. Stadler, T. Luckenbach (2019) "Indication of ongoing amphipod speciation in Lake Baikal by genetic structures within endemic species". BMC Evolutionary Biology. 19:138
 
     
P. Drozdova, D. Bedulina, E. Madyarova, L. Rivarola-Duarte, S. Schreiber, P. F. Stadler, T. Luckenbach, M. Timofeyev (2019) "Description of strongly heat-inducible heat shock protein 70 transcripts from Baikal endemic amphipods", Scientific reports, 9,  8907   
     

M.V. Moore, B.T. De Stasio Jr., K.N. Huizenga, E.A. Silow (2018) Trophic coupling of the microbial and the classical food web in Lake Baikal, Siberia. Freshwater Biology. DOI: 10.1111/fwb.13201

 
     
Vereshchagina K.P., Kondrateva E.S., Axenov-Gribanov D.V., Shatilina Zh.M.,Khomich A.S., Bedulina D.S., Zadereev E. S., Timofeyev M.A. (2018) Nonspecific stress response to temperature increase in Gammarus lacustris Sars with respect to oxygen-limited thermal tolerance concept. PeerJ 6:e5571  
 
     

Voytsekhovskaya IV, Axenov-Gribanov DV, Murzina SA, Pekkoeva SN, Protasov ES, Gamaiunov SV, Timofeyev MA. (2018) Estimation of antimicrobial activities and fatty acid composition of actinobacteria isolated from water surface of underground lakes from Badzheyskaya and Okhotnichya caves in Siberia. PeerJ 6:e5832  

 
     
R. I. Woolway, L. Carrea, C. J. Merchant, M. T. Dokulil, E. de Eyto, C. L. DeGasperi, J. Korhonen, W. Marszelewski, L. May, A. M. Paterson, A. Rimmer, J. A. Rusak, S. G. Schladow, M. Schmid, S. V. Shimaraeva, E. A. Silow, M. A. Timofeyev, P. Verburg, S. Watanabe, and G. A. Weyhenmeyer, 2018: Lake surface temperature [in “State of the Climate in 2017”]. Bull. Amer. Meteor. Soc., 99 (8), S13–S15, doi:10.1175/2018BAMSStateoftheClimate.1.  
     
Dimova M., Madyarova E., Gurkov A., Drozdova P., Lubyaga Y., Kondrateva E., Adelshin R., Timofeyev M.  Genetic diversity of Microsporidia in the circulatory system of endemic amphipods from different locations and depths of ancient Lake Baikal. 2018.  PeerJ 6:e5329
 
     
Borvinskaya, E., Gurkov, A., Shchapova, E., Karnaukhov, D., Sadovoy, A., Meglinski, I., Timofeyev, M. Simple and Effective Administration and Visualization of Microparticles in the Circulatory System of Small Fishes Using Kidney Injection. J. Vis. Exp. (136), e57491, doi:10.3791/57491 (2018).  
     
Bowman, L. L., Kondrateva, E. S., Timofeyev, M. A. and Yampolsky, L. Y. (2018), Temperature gradient affects differentiation of gene expression and SNP allele frequencies in the dominant Lake Baikal zooplankton species. Molecular ecology.  doi:10.1111/mec.14704  
     
Gurkov, A., Borvinskaya, E., Shchapova, E., Timofeyev, M.  Restraining small decapods and amphipods for in vivo laboratory studies (2018) Crustaceana, 91 (5), pp. 517-525. 
 
     
Borvinskaya, E., Gurkov, A., Shchapova, E., Baduev, B., Meglinski, I., Timofeyev, M. Distribution of PEG-coated hollow polyelectrolyte microcapsules after introduction into the circulatory system and muscles of zebrafish (2018) Biology Open, 7 (1), статья № bio030015, .   
     
Shchapova, E.P., Axenov-Gribanov, D.V., Lubyaga, Y.A., Shatilina, Z.M., Vereshchagina, K.P., Madyarova, E.V., Protasov, E.S., Timofeyev, M.A. Crude oil at concentrations considered safe promotes rapid stress-response in Lake Baikal endemic amphipods (2018) Hydrobiologia, 805 (1), pp. 189-201.   
     
Protasov, E.S., Axenov-Gribanov, D.V., Rebets, Y.V., Voytsekhovskaya, I.V., Tokovenko, B.T., Shatilina, Z.M., Luzhetskyy, A.N., Timofeyev, M.A. The diversity and antibiotic properties of actinobacteria associated with endemic deepwater amphipods of Lake Baikal (2017) Antonie van Leeuwenhoek, International Journal of General and Molecular Microbiology, 110 (12), pp. 1593-1611.  
     
Borvinskaya E., Gurkov A., Shchapova E., Baduev B., Meglinski I., Timofeyev M.  Distribution of PEG-coated hollow polyelectrolyte microcapsules after introduction into the circulatory system and muscles of zebrafish. Biology Open 2018. 7: bio030015      
     
Hampton S.E,…, Silow E.A.,…, Timofeyev M.A., et al. Ecology under lake ice. Ecology letters, (2017) 20: 98–111  
     
Timofeyev M.A., Silow E.A., Mackay A.W., Moore M.V., Likens G.E. (2016) Safeguarding the world’s largest lake. Nature. Vol.538, № 7623, pp. 41  
 
 
 
Sharma, S… L.R. Izmest’eva, E.A. Silow… et al. A global database of lake surface temperatures collected by in situ and satellite methods from 1985–2009. Scientific Data (Nature Publishing Group) 2:150008 doi: 10.1038/sdata.2015.8.
 

 



Материалы в СМИ и интернет-медиа:

  • Открытая лекция директора института д.б.н. Максима Тимофеева в рамках первой летней школы академического совершенства — образовательном проекте, объединяющего лучшие практики укрепления конкурентоспособности университетов (ТюмГУ, СФУ). В лекции дан обзор передовых научных проектов, выполняемых в институте, а также приведены базовые сведения об экологии озера Байкал и факторах, обуславливающих его уникальность как объекта научных исследований.  

 
 
  • Документальный фильм «12 тысяч проб» о нейросети, создаваемой для мониторинга зоопланктона оз.Байкал учеными НИИ биологии "ИГУ" совместно с разработчиками моделей искусственного интеллекта для изучения морских экосистем MaritimeAI, командой облачной платформы Yandex.Cloud и Фондом поддержки прикладных экологических разработок и исследований «Озеро Байкал».

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Новости

Июнь 2024. В журнале Вавиловский журнал генетики и селекции (Q2) опубликована совместная статья сотрудников НИИ биологии "ИГУ" и ЛИН СО РАН: Дроздова и др.  «Байкальские амфиподы и их геномы, большие и малые».  
---
Май 2024. Молодые ученые НИИ биологии ИГУ приняли участие в IV Всероссийской Конференции «Актуальные проблемы изучения ракообразных», проходящей на базе Института биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН (ИБВВ РАН) в пос. Борок Ярославской области.  В рамках конференции была представлена серия докладов с материалами научных исследований, выполняемых в институте: «Филогенетическое разнообразие эндемичных амфипод в озере Байкал и реке Ангара» (докладчик: Александра Саранчина),  «Сравнение протеома гемоцитов литоральных и глубоководных эндемичных байкальских амфипод» (Елена Золотовская), «Первичные культуры клеток в изучении байкальских эндемичных амфипод» (Анна Назарова), «Некоторые аспекты формирования стресс-ответа амфипод на примере индуцибельной формы бтш70» (Екатерина Мальярова), «Поведенческая и физиологическая реакция байкальских эндемичных и голарктических видов амфипод на гипероксические условия в окружающей среде» (Ярослав Ржечицкий). По итогам конференции, доклад к.б.н. Полины Дроздовой «Репродуктивные барьеры внутри распространённых видов байкальских амфипод» был признан лучшим устным докладом конференции.
---
Май 2024. В журнале PeerJ (IF 2.7, Q1) опубликована статья сотрудников НИИ биологии "ИГУ": Nazarova et al. "Leeches Baicalobdella torquata feed on hemolymph but have a low effect on the cellular immune response of amphipod Eulimnogammarus verrucosus from Lake Baikal".
---
Апрель 2024. Молодые ученые НИИ биологии ИГУ приняли участие в 62-й Международной научной студенческой конференции – МНСК 2024, проходившей на базе Новосибирского государственного университета с 18 по 23 апреля. В рамках конференции были представлены сообщения: "Влияние акклимации байкальских амфипод к повышенным температурам на выживаемость их иммунных клеток в первичной культуре" (докладчик Седова Софья) и «Воздействие экологически реалистичных уровней ультрафиолета на различные возрастные группы байкальских литоральных эндемичных амфипод Eulimnogammsrus verrucosus» (докладчик Анастасия Дягилева)  
---

Апрель 2024. Научный сотрудник НИИ биологии "ИГУ" Широкова Юлия выступила с устным докладом "Быстрая декомпрессия и повышение температуры среды приводит к увеличению образования лактата у байкальских эврибатных амфипод рода  Ommatogammarus?" на 77-й международной школе-конференции молодых ученых "Биосистемы: организация, поведение, управление", проходившей 15-19 апреля в ННГУ имени Лобачевского в Нижнем Новгороде.

---
Апрель 2024. В журнале "Acta Biologica Sibirica" (Scopus, Q2) опубликованы сразу две статьи молодых ученых НИИ биологии ИГУ.  Статья Ermolaeva et al. "Daily vertical migrations of aquatic organisms and water transparency as indicators of the potential exposure of freshwater lakes to light pollution» приводит результаты исследований суточных вертикальных миграций организмов в трех крупных озерных экосистемах: древних рифтовых озерах Байкал и Хубсугул, а также ледниковом Ладожском озере. В работе оценивали влияние светового загрязнения на наиболее уязвимые группы и виды организмов. Данный вид загрязнения является следствием использования искусственного освещения в ночное время, которое негативно влияет на ритмы живых организмов.  Во второй статье Maslennikova et al. “Potential causes for the stranding of Macrohectopus branickii (Dybowsky, 1874) specimens along the Angara River: strong currents, artificial lighting, or ice melting” описывается случай выброса особей пелагической амфиподы макрогектопуса Браницкого на берег Ангары и анализируются вероятные причины данного явления, в том числе факторы течения и светового загрязнения.  
---
Апрель 2024. Научный сотрудник НИИ биологии ИГУ к.б.н. Екатерина Щапова выступила с докладом "Применение имплантируемых оптических сенсоров для мониторинга pH в различных тканях гидробионтов" на Конгрессе молодых учёных в Санкт-Петербурге.  Конгресс проходил на базе Национального исследовательского университета ИТМО с 8 по 12 апреля.
---
Апрель 2024.  По результатам конкурса междисциплинарных исследовательских проектов Российского научного фона (РНФ) поддержан проект «Биологические ресурсы экстремальных водных экосистем: экология, биоразнообразие и оценка возможностей практического применения в сельском хозяйстве и аквакультуре», руководитель д.б.н. Елена Ануфриева. Проект будет выполняться коллективами двух научных институтов: головной институт ФИЦ "Институт биологии южных морей имени А.О. Ковалевского РАН"(Севастополь) и НИИ биологии «ИГУ» как соисполнитель.
---
Апрель 2024.  Фонд «Озеро Байкал» вновь окажет поддержку проекту долговременного экологического мониторинга озера Байкал - «Точка №1». В 2024 году фондом выделен грант в размере 1 500 000 рублей, первый транш уже поступил в ИГУ. Руководитель грантового проекта молодой ученый, кандидат биологических наук Ольга Русановская. 
Проект «Точка №1» считается самым длительным проектом долговременного экологического мониторинга планктона в истории науки. Он был запущен известным исследователем озера профессором Михаилом Кожовым еще в феврале 1945 года и непрерывно продолжается до настоящего времени. Проект включен в «Книгу рекордов России». В рамках ведущихся наблюдений ученые НИИ биологии ИГУ проводят регулярные (примерно раз в две недели) отборы проб фито- и зоопланктона, замеряют показатели состояния пелагиали - толщи воды. Все собранные материалы заносятся в единую базу, которая представляет массив ценной информации для научного сообщества.
Получаемые в результате мониторинга данные ежегодно вносятся в глобальный международный отчет по климату «State of the Climate», а также в Государственный доклад «О состоянии озера Байкал и мерах по его охране» Минприроды РФ.
---
Март 2024. В журнале Comparative Biochemistry and Physiology -Part A : Molecular and Integrative Physiology  (IF 2.3, Q1) опубликована статья сотрудников НИИ биологии "ИГУ":  Kondrateva et al.. Thermal tolerance of a freshwater amphipod Gammarus lacustris can be enhanced by acclimation to higher mineralization.
---
Январь 2024. В журнале Applied Microbiology and Biotechnology  (IF 5, Q1) опубликована статья сотрудников НИИ биологии "ИГУ": Drozdova et al.. Transcriptional response of Saccharomyces cerevisiae to lactic acid enantiomers.
---
Декабрь 2023.  Заместитель директора по науке, ведущий научный сотрудник НИИ биологии ИГУ, кандидат биологически наук Антон Гурков награжден Почетной грамотой губернатора Иркутской области.
---
Декабрь 2023. Приказом Минобрнауки РФ ведущий научный сотрудник НИИ биологии ИГУ кандидат биологически наук Полина Дроздова награждена ведомственным нагрудным знаком "Молодой ученый"
---
Ноябрь 2023. Проекты сотрудников НИИ биологии ИГУ «Комплексное изучение загрязнения озера Байкал микропластиком и потенциальное влияние частиц микропластика с разной морфологической структурой на байкальских амфипод и брюхоногих моллюсков» (руководитель м.н.с. Дмитрий Карнаухов) и «Световой фактор в вертикальных миграциях гидробионтов в озере Байкал» (руководитель д.б.н. Евгений Зилов) получили поддержку Российского научного фонда (РНФ) по мероприятию «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами».
---
Ноябрь 2023. Сотрудники НИИ биологии ИГУ к.б.н. Полина Дроздова, к.б.н. Ксения Верещагина, м.н.с. Дмитрий Карнаухов и аспирант Софья Бирицкая приняли активное участие в качестве лекторов на Школе молодого ученого ИГУ "Грантовая поддержка молодых ученых", прошедшей 11 ноября. В рамках школы ученые института поделились опытом написания заявок на гранты, умением работать с научной литературой и ее поиском.
---
Октябрь 2023. C 4 по 12 октября 2023 года на базе Зоологического института РАН (Санкт-Петербург) проходила Всероссийская школа молодых ученых «Высокопроизводительное секвенирование, получение и анализ данных в филогенетике». Сотрудники НИИ биологии ИГУ приняли в школе активное участие. Так к.б.н., в.н.с. НИИ биологии ИГУ Полина Дроздова выступала преподавателем школы, а аспирант Ярослав Ржечицкий посетил школу в качестве участника. Программа школы включала как теоретическую часть с лекциями ведущих исследователей, так и практические занятия, на которых у участники познакомились с основными методами анализа данных полногеномного секвенирования.
---
Октябрь 2023. Младший научный сотрудник НИИ биологии ИГУ Юлия Широкова выступила с докладом "Оценка стресс-реакции байкальских эндемичных глубоководных амфипод Ommatogammarus flavus и O. albinus на повышение температуры среды с учетом глубины их обитания" на конференции «Антропогенное влияние на водные организмы и экосистемы». Конференция проходила Институте биологии внутренних вод имени И. Д. Папанина  РАН (п. Борок) в период с 17 по 20 октября.
---
Октябрь 2023. На заседании диссертационного совета Института биологии внутренних вод имени И. Д. Папанина РАН состоялась успешная защита диссертаций на соискание степени кандидата биологических научного сотрудника НИИ биологии «ИГУ» - Екатерины Щаповой (диссертация на тему  Исследование эндосимбионтной микрофлоры гемолимфы и реакции на неё иммунной системы байкальского эндемичного вида амфипод Eulimnogammarus verrucosus)
---

Сентябрь 2023.  Ученые НИИ биологии "ИГУ" приняли участие в  IV Всероссийской научно-практической конференции «Развитие жизни в процессе абиотических изменений на земле, проходившей с 25 по 29 сентября в п. Листвянка, на базе Байкальского музея СО РАН. В ходе конференции была представлен серия докладов: «Снижение устойчивости к УФ-излучению эндемичных амфипод озера Байкал при их распространении в глубоководную зону» (Екатерина Кондратьева.),  «Роль гемоцитов в клеточном и гуморальном иммунитете байкальских эндемичных амфипод» (Анна Назарова), «Возможности имплантируемых оптических сенсоров для мониторинга pH в различных органах водных животных» (к.б.н. Антон Гурков), «Исследование микробиологии гемолимфы эндемичного байкальского вида амфипод Eulimnogammarus verrucosus» (Екатерина Щапова), «Мониторинг экосистемы озера Байкал с использованием новых нейросетевых инструментов»  (к.б.н. Ольга Русановская), «Морфологическое разнообразие и генетическая однородность двух близкородственных видов байкальских эндемичных амфипод рода Ommatogammarus на разных глубинах озера Байкал» (Екатерина Мадьярова),  «Географические барьеры и репродуктивная изоляция в формировании криптический видов внутри массовых представителей байкальских эндемичных амфипод рода Eulimnogammarus» (к.б.н. Полина Дроздова)

---
Сентябрь 2023.  Младший научный сотрудник НИИ биологии "ИГУ" Александра Саранчина представила доклад «Изучение эволюционных процессов в Байкальском бассейне на примере эндемичного вида амфипод Eulimnogammsrus verrucosus» на V международной конференции, VIII всероссийском международном научном форуме “Наука будущего наука молодых”. Конференция проходила в рамках десятилетия науки и технологий, при поддержки министерства науки и высшего образования РФ в городе Орел с 20-23 сентября.
---
Сентябрь 2023. Сотрудники НИИ биологии ИГУ приняли участие во Всероссийской конференции "Морская биология в 21 веке: биология развития, молекулярная и клеточная биология, биотехнология морских организмов" проходившей с 12 по 15 сентября на базе Национального научного центра морской биологии им. А.В. Жирмунского ДВО РАН и Приморского океанариума (г. Владивосток). В рамках конференции заместитель директора по науке, к.б.н. Антон Гурков выступил с докладом на тему "Варианты исполнения имплантируемых оптических сенсоров для применения в рыбах и ракообразных на примере pH-сенсоров", ведущий научный сотрудник, к.б.н. Екатерина Борвинская представила доклад "Физиолого-биохимическая характеристика радужной форели во время вспышки вибриоза на морском садковом хозяйстве", а младший научный сотрудник института Анна Назарова доклад "Получение первичных культур клеток различных тканей амфипод и сравнение их выживаемости с реакцией на организменном уровне".
---
Сентябрь 2023. Проект долговременного экологического мониторинга озера Байкал «Точка №1» вышел в финал отбора национальной премии «Хрустальный компас», в номинации «Научное достижение».     «Хрустальный компас» — премия в области географии, экологии, сохранения и популяризации природного и историко-культурного наследия. Проводится под эгидой Русского географического общества при поддержке Президентского фонда культурных инициатив. Победители определяются в 11 номинациях, каждая из которых предполагает высокие достижения в области национальной географии и экологии, сохранении и популяризации природного и историко-культурного наследия.  
---
Сентябрь 2023. Сотрудники НИИ биологии ИГУ приняли участие в международной конференции Хромосома-2023, которая проходила в Новосибирске с 5 по 10 сентября.
Младший научный сотрудник НИИ биологии Екатерина Мадьярова представила доклад «Genome size and population genetic structure of two closely related species of Baikal endemic amphipods of the genus Ommatogammarus in the depth gradient». Ведущий научный сотрудник НИИ биологии, к.б.н. Полина Дроздова представила доклад «Reproductive barriers, genome size, and repeat composition in endemic species of Baikal amphipods (Crustacea: Amphipoda) of the genus Eulimnogammarus».
---
Сентябрь 2023. Опубликован ежегодный международный отчет «State of the Climate 2022» с результатами научной оценки состояния климата нашей планеты.  Глобальная сводка, издаваемая Американским метеорологическим обществом, выпускается в качестве специального номера журнала «Bulletin of the American Meteorological Society» (Q1, Impact Factor - 8.766). Уже более тридцати лет эти отчёты служат основным источником научных данных о состоянии климата планеты. В текущий отчет, объемом более полутысячи страниц, сведены результаты работы 584 исследователей из 68 стран мира, осуществляющих наблюдения за состоянием глобальных климатических процессов, а также дана оценка событий, происходящих в атмосфере планеты, в океанах и на континентах.  В том числе в отчет включены материалы наблюдений, полученные в рамках проекта долговременного экологического мониторинга планктона озера Байкал – «Точка №1», выполняемого учеными НИИ биологии Иркутского государственного университета.
---
Сентябрь 2023.  На базе НИИ биологии «ИГУ» состоялась Байкальская летняя школа-конференция молодых учёных «Современные методы изучения гидробионтов», приуроченной к 100-летию НИИ биологии ИГУ. Школа проходила в период с 25 августа по 3 сентября 2023 г.
Исследовательская и образовательные программы были поделены на полевую и лабораторную части, которые выполнялись на байкальской биостанции в пос. Большие Коты (Южный Байкал) и в аналитических лабораториях института (г. Иркутск).
Направления школы включали как классические, так и новейшие тематики исследований водных обитателей: изучение влияния светового загрязнения на обитателей литорали Байкала, биохимические исследования байкальских и голарктических видов, применение имплантируемых оптических сенсоров в гидробионтах и молекулярную филогенетику байкальских амфипод. 
В работе школы приняли участие более 20 молодых ученых из университетов и академических институтов Москвы, Санкт-Петербурга, Новосибирска, Петрозаводска, Кемерово, Ставрополя и Нижнего Новгорода, а также сотрудники самого НИИ биологии ИГУ.
---
Август 2023.  Директор института доктор биологических наук Максим Тимофеев, принял участие в работе Национальной конференции по маркетингу университетов - SERP ’23. В своем выступлении в рамках секции «Научный маркетинг», на примере НИИ биологии «ИГУ», М.А. Тимофеев затронул темы продвижения бренда исследовательского института и популяризации научного знания, а также подходов к запуску новых междисциплинарных проектов и привлечения активных людей в науку.  Организатор конференции – учебный центр подготовки руководителей (Кочубей-центр) НИУ Высшая Школа Экономики в Санкт-Петербурге.
---
Август 2023.  В журнале Gels (IF 4.6, Q1) опубликована статья сотрудников НИИ биологии "ИГУ":  Borvinskaya et al. Tissue Reaction to Low-Density Polyacrylamide Gel as a Carrier for Microimplants in the Adipose Fin of Rainbow Trout.
 
В статье приведены материалы исследования иммунного ответа радужной форели на подкожную инъекцию желеобразного полиакриламидного гидрогеля и оценки безопасности применения этого полимера в качестве каркаса для сенсорных микрокапсул, заполненных светящимся индикаторным веществом. По результатам проведённых экспериментов установлено, что введение полужидкого полиакриламидного гидрогеля не оказывает значительного влияния на общее здоровье рыб, о чем свидетельствует отсутствие изменений в синтезе провоспалительных сигнальных молекул в селезенке форели.   В целом, наблюдения непосредственно в тканях живых рыб показывает, что гель-золи полиакриламида могут расширить линейку возможных покрытий для микросенсоров, хотя они не лишены недостатков, присущих и другим биоразлагаемым аналогами (такими как альгинат, хитозан и другие), поскольку пока еще не позволяют создавать оптические микроимпланты стабильные в течение месяцев.  
---

см. весь архив новостей

 

Руководство

Директор -  д.б.н. Тимофеев Максим Анатольевич

Зам. директора по науке - к.б.н. Гурков Антон Николаевич

Зам. директора по общим вопросам - Парфенова Наталья Сергеевна

Зам. директора по хозяйственным и экономическим вопросам - Шипицына Елена Владимировна

Ученый секретарь - к.б.н. Шимараева Светлана Владимировна